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专业化学。爱好文学。同时还喜欢美术、摄影、哲学、经济学、新闻传播学和计算机。目前乐器小提琴,最想学的乐器是钢琴。对ACG有爱。

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Gaussian09的安装  

2010-10-25 19:04:49|  分类: Computer |  标签: |举报 |字号 订阅

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基本上跟Gaussian03没有区别
1.解压
2.将解压出来的g09文件夹copy到你想要的地方,比如/usr/local/
3.进入/usr/local,更改g09文件夹的权限。最好是将需要使用g09的用户划分到一个组,然后将g09文件夹的所属用户组改成这个组
4.进入g09文件夹,建立一个名为scratch的文件夹,并且将其权限改为777。(你要建立在别的地方也可以,需要修改相应配置)
5.进入/etc,修改bash.bashrc或者bash.bashrc.local什么的(总之就是设置环境变量)。加入以下几行:
#gaussian09
export PATH=/usr/local/g09:$PATH
export g09root=/usr/local/g09
source $g09root/g09/bsd/g09.profile   #我以前配g03的时候没这句也行
export GAUSS_EXEDIR=$g09root
export GAUSS_SCRDIR=$g09root/scratch    #取决于你新建目录的位置,如果是/tmp就改成/tmp
export LD_LIBRARY_PATH=$g09root/
6.保存退出之后,source该文件
之后就OK了

可能遇到的问题:
1.运行g09后出错,查看log文件,信息如下:
Entering Gaussian System, Link 0=g09
Input=1.com
Output=1.log
Files in the Gaussian directory are world accessible.
This must be fixed.
原因是g09文件夹权限太高,如果整个改成777就有可能出这个问题。解决办法是除了scratch目录以外,均用755或者750等。(所以之前建议用更改用户组的办法来实现权限)

2.著名问题:
Erroneous write during file extend. write -1 instead of 4096
Probably out of disk space.
Write error in NtrExt1: Bad address
Segmentation fault
解决办法:
sudo echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space
最好写进/etc/rc.local文件(ubuntu系统,其他系统写进相应文件),令其开机自动加载该命令,省时省力
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